Гъбичните инфекции често възникват от обикновен дисбаланс на микроорганизмите, които естествено присъстват в тялото.

Всъщност той е колонизиран от множество различни гъбички и бактерии, през повечето време безвредни и дори от съществено значение за правилното функциониране на тялото.

Възможно е обаче някои от тези гъби да се размножават и да станат патогенни, или „външна“ гъба, предавана например от животно, да причини инфекция. Общо 200-400 вида гъби могат да причинят заболяване при хората⁵.

Въпреки това, гъбите, присъстващи в околната среда, също могат да заразят хората, например:

• чрез инокулация, например по време на нараняване (водещо до споротрихоза или хромомикоза и др.);
• чрез вдишване на плесени (хистоплазмоза, апергилоза и др.);
• при контакт със заразен човек (кандидоза, трихофития и др.);
• чрез контакт със заразено животно.